同济大学
导师风采
沈仕君
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个人信息

Personal Information

  • 副研究员
  • 导师类别:硕士生导师
  • 性别: 男
  • 学历:博士研究生
  • 学位:博士

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:生命科学与技术学院
  • 所属专业: 生物学
  • 邮箱 : 22310176@tongji.edu.cn
  • 工作电话 : -13795384821

个人简介

Personal Profile

    沈仕君,博士,副研究员,民建同济大学委员会一支部副主委。长期聚焦细胞命运决定中的染色质重塑及其表观遗传调控机制。以生殖发育为核心,通过发展生物信息学分析方法,结合微量组学、单细胞及空间多组学、基因编辑与临床队列,重点解析了生理及病理状态下,人和小鼠胚胎及器官(如性腺)发育过程中,转录因子调控、染色质开放、组蛋白修饰、DNA甲基化等重要表观景观重塑模式及其调控细胞命运决定的分子机制。近期,尝试利用最新时空组学技术,结合人工智能,开展了一系列图谱绘制与机制解析工作。

    相关研究成果以第一作者(含并列)或通讯作者(含共同)发表在Cell Research、Cell Reports Medicine、Nucleic Acids Research、EMBO Journal等国际知名学术期刊;主持国家自然科学基金青年项目,主持中国博士后科学基金面上项目,主持上海市人才计划(启明星-扬帆)等;担任Advanced系列期刊Advanced Genetic副编委、Nature系列期刊Nature communication审稿人等学术职务;荣获上海生物信息学会2025年度学术年会最佳口头报告奖一等奖、中国遗传学会2025年度表观遗传与染色质生物学大会特邀报告、复旦生命科学国际暑期学校学生学术研讨会优秀海报奖一等奖等荣誉;曾获同济大学优秀毕业生(博士)、同济大学优秀博士论文、博士研究生奖学金等荣誉奖励。


  • 研究方向Research Directions
生物信息学,表观遗传组学,时空组学,发育生物学,人工智能
2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行整体布局设计。 整体布局设计。
团队展示

工作时,大家或冥思苦想、或埋头苦读paper、或全神贯注写代码、或在纸上写写画画、或在激烈地讨论着问题...此时,大家都沉浸在忘我的境界,尽情地在未知的世界里遨游探索...

放松时,大家聚在一起吃着零食分享心得,聊着开心的事,也不乏津津有味地传着八卦...欢声笑语此起彼伏,劳累的大脑也得到了休息,满血复活,为下一轮工作做准备。

身体是革命的本钱。实验室的小伙伴们都很注重锻炼,有坚持跑步的独行侠,也有爱跳舞的达人,还有与生命之源拥抱的游泳潮儿。历史最悠久的要属打羽毛球,实验室柜子上摆满了奖杯!我们的口号是:Work hard, play hard! 

生活中,同学们互助友爱、乐于奉献、也好为人师,分享经验与教训。大家在一个温馨和睦的环境中汲取知识、领悟人生道理!

课题组主页: https://wukong.tongji.edu.cn


项目情况

主持国家自然科学基金青年项目

主持中国博士后科学基金面上项目

主持上海市人才计划(启明星-扬帆)


报考意向
招生信息
生命科学与技术学院
硕士研究生
  • 序号
  • 专业
  • 招生人数
  • 年份
报考意向
姓名:
手机号码:
邮箱:
毕业院校:
所学专业:
报考类型:
博士
硕士
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其他材料:

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备注:
科研项目

主持国家自然科学基金青年项目

主持中国博士后科学基金面上项目

主持上海市人才计划(启明星-扬帆)


研究成果

代表性文章(Selected Publications,* 并列第一,#共同通讯):


1. Shen S*, Wang M*, Li X*, Wang B*, Hong W*, Li W, Xu B, Guo Z, Han R, Yi S, Wu Z, He X, Wang L, Zhu Q, Yang G, Wang H, Deng Q, Chen J#, Gao S#, Jiang C#, Gao R#. The gonadal niche safeguards human fetal germline cell development following maternal SARS-CoV-2 infection. Cell Reports Medicine, 2024, 5(5): 101515

说明:本研究揭示了孕早期母源性急性冠状病毒感染对胚胎生殖细胞发育的影响。发现胎儿可感知外界(母体)恶劣环境,揭示胎儿性腺通过预先建立免疫抵抗,进而维护生殖细胞正常发育的关键机制。

 

2. Li J*, Shen S*, Chen J*, Liu W, Li X, Zhu Q, Wang B, Chen X, Wu L, Wang M, Gu L, Wang H, Yin J, Jiang C#, Gao S#. (2018) Accurate annotation of accessible chromatin in mouse and human primordial germ cells. Cell Research , 2018, 28(11): 1077-1089

说明:本研究利用最新优化的low-input DNase-seq技术结合生物信息学大数据分析,精确注释了原始生殖细胞(PGC)发育过程中染色质的开放状态,为PGC发育过程中各个重要生物学事件提供了重要线索。发现利用染色质开放富集区域可精准预测雌性PGC的同源重组热点并解析其进化特征,揭示原始生殖细胞发育过程中的关键基因及其表观遗传调控机制。

 

3. Shang X*, Shen S*#, Tang J*, He X, Zhao Y, Wang C, He X, Guo G, Liu M, Wang L, Zhu Q, Yang G, Jiang C, Zhang M, Yu X, Han J, Culleton R, Jiang L, Cao J#, Gu L#, Zhang Q# (2021) A cascade of transcriptional repression determines sexual commitment and development in Plasmodium falciparum. Nucleic Acids Research, 2021, 49(16): 9264-9279

说明:本研究揭示抑制型转录因子AP2-G5通过改变局部表观遗传环境,逐级关闭已完成功能的基因,从而有序控制配子正常发育进程的复杂机制。引用50+,high light in F1000。

 

4. She X*, Shen S*, Chen G*, Gao Y*, Ma J, Gao Y, Liu Y, Gao G, Zhao Y, Wang C, Jiang C#, Wang P#, Qin H#, Gao H# (2023) Immune surveillance of brain metastatic cancer cells is mediated by IFITM1. EMBO Journal, 2023, 42(7): e111112

说明:本研究发现通过改变转录因子调控可干扰跨膜蛋白IFITM1稳定性,从而影响肿瘤细胞命运与免疫微环境的新机制。

 

5.Fan Y*, Shen S*, Wei G*, Tang J*, Zhao Y, Wang F, He X, Guo G, Shang X, Yu X, Ma Z, He X, Liu M, Zhu Q, Le Z, Wei G, Cao J, Jiang C#, Zhang Q#. (2020) Rrp6 Regulates Heterochromatic Gene Silencing via ncRNA RUF6 Decay in Malaria Parasites. mBio, 2020, 11(3): e01110-20

说明:本研究发现RRP6通过降解新生非编码RNA-Ruf6,维持基因组特定区域异染色质状态与高级结构,控制该区域致病基因有序表达,从而实现在人体内免疫逃逸的新机制。

 

6.沈仕君。原始生殖细胞的命运决定。2021年《科学1915》


研究方向(包括但不限于)

研究方向:

1、胚胎及生殖发育中的表观遗传调控机制、表型关联与器官微环境研究

2、细胞命运决定与转变中的表观遗传调控机制、表型关联与微环境研究

3、时空组学分析应用与算法开发


招生专业(包括但不限于)

招生专业:

1、生物信息与人工智能

2、发育、衰老与疾病

3、遗传与表观遗传学


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