同济大学
导师风采
曹端华
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个人信息

Personal Information

  • 研究员
  • 导师类别:硕士,博士生导师
  • 性别: 男
  • 学历:博士研究生
  • 学位:博士

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:生命科学与技术学院
  • 所属专业: 生物学  、 生物与医药
  • 邮箱 : caodh@tongji.edu.cn
  • 工作电话 : -

个人简介

Personal Profile

嗨,大家好!我是曹端华(个人主页:https://caodh.github.io/caoduanhua.github.io )。我的研究主要聚焦于人工智能与药物设计的交叉领域,研究内容包括不同模态的药物分子筛选、生成、及优化等。 研究工作发表在Nat. Methods、Nat. Mach. Intell.、Nat. Immunol. 等期刊。在同济大学生物信息学系,我们团队专注于人工智能与药物设计的前沿交叉方向,致力于: (1) 通过生成式人工智能(例如Diffusion、Flow Matching、LLM)整合多模态数据进行分子发现和设计(2) 基于结构/序列的智能药物精准推荐系统(3)利用大语言模型从蛋白-配体数据中学习和推理,并用于药物的发现和改造。 近年来,AI for Science(人工智能驱动的科学研究)在全球范围内掀起热潮。从AlphaFold系列破解蛋白质结构预测难题,到生成式AI 加速新材料、新药物发现,人工智能正以前所未有的方式重塑传统科研模式。总书记说”人工智能是年轻的事业,也是年轻人的事业“,我们诚邀博士生、硕士生、博士后、研究助理、以及本科同学加入我们这个年轻的团队,一起探索这个充满潜力与未知的领域!当然也非常欢迎合作者可以多多考虑我们!


  • 研究方向Research Directions
人工智能,药物设计,机器学习,蛋白设计,生物信息学
2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行整体布局设计。 整体布局设计。
科研项目

我们的研究将聚焦于人工智能、生物信息学与药物设计的交叉领域,旨在开发新一代智能系统,为临床患者寻找更好的药物,具体包含:

  • Molecular discovery and design using generative models (small molecule, peptide, antibody ...)
  • Structure- and sequence-based virtual screening and Drug Recommendation System
  • Learning and reasoning from protein–ligand complex data using LLM
  • Multimodal deep learning for binding affinity and complex structure prediction


研究成果

前期研究重点: 开发具有高泛化性的蛋白-配体相互作用预测算法,并将这些算法应用于:

• 蛋白-配体复合物结构预测 (Nature Methods 2024;)

• 相对亲和力评估与分子优化 (Nature Computational Science 2023)

• 化合物筛选 (Nature Machine Intelligence 2024Nature Immunology 2023)


学生信息
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推免人数
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