实验室研究方向紧贴国际前沿领域，具备先进的干湿实验平台（生物计算平台 + 分子细胞实验平台）；现有副研究员一名，专职科研行政管理人员一名。

副研究员：

王颖黎 博士

王颖黎博士于复旦大学，获得遗传学博士学位。博士毕业就职于中国科学院上海有机化学研究所，生命过程小分子调控国家重点实验室，先后任助理研究员、副研究员职位。工作期间以主持人身份主持1项国家自然基金项目，以参与者身份参与多项国家重点研发项目以及上海市科研项目。以一作身份或合作作者身份发表过多篇JCR收录文章。

主要研究方向

• * 以细胞选择性巨自噬以及微自噬为主要研究方向，探索上述过程中的基因异常与复杂疾病疾病发生相关的具体分子机制
• * 紧密结合相关疾病的大数据分析和计算生物学结果，进行细胞分子生物学功能验证和分子机制研究
• * 根据蛋白结构解析结果和临床样本，探索相关小分子靶点和开展功能研究
• * 基于CRISPR技术的高通量靶点文库制备和筛选，结合医院的临床样本及数据，开展相关疾病下游生物学功能相关实验

1. 深入东亚人群复杂疾病（如肺纤维化，心血管疾病等）的研究，筛选东亚人群中相关疾病的特异位点；通过单细胞分析和机器学习方法，构建复杂疾病单细胞图谱，优化心血管疾病预防模型，推动精准医学和公共卫生预防研究的转化应用开发。

2. 推进新药靶点验证和药物重定位临床转化，通过机器学习方法开发，干湿结合验证，进行药物靶点发掘和鉴定；

3. 开展复杂疾病方向大数据分析和统计遗传新算法、新工具的开发，保持前沿领域国际合作。

详细信息请参考：

https://medgroup.tongji.edu.cn/Group.aspx?id=3082

https://fangbucks.com/chenlab/

近年代表性论文专著 （*同等贡献）

1. 1. Chen F*, Wang X*, ..., Vrieze S, Liu DJ. Multi-ancestry transcriptome-wide association analyses yield insights into tobacco use biology and drug repurposing. Nature Genetics (Co-first author). 2023 Jan 26:1-0.
2. 2. Genetic diversity fuels gene discovery for tobacco and alcohol use. Saunders G*, Wang XY*, Chen F*, Jang JK, Dajiang Liu. (Co-first author); Nature, 2022: 1-7. 2022
3. 3. Integrating 3D genomic and epigenomic data to enhance target gene discovery and drug repurposing in transcriptome-wide association studies; Khunsriraksakul C, McGuire D, Sauteraud R, Chen F, Liu DJ; Nature Communications, 2022, 13(1): 1-15.
4. 4. Inferring genes that escape X-Chromosome inactivation reveals important contribution of variable escape genes to sex-biased diseases; Sauteraud R, Stahl J M, James J, Englebright M, Chen F, Zhan X, Carrel L, Liu DJ; Genome research, 2021 Sep 1;31(9):1629-37.
5. 5. Model-based assessment of replicability for genome-wide association meta-analysis. McGuire D, Jiang Y, Liu M, Weissenkampen JD, Eckert S, Yang L, Chen F, Berg A, Vrieze S, Jiang B, Li Q; Nature communications. 2021 Mar 30;12(1):1-4.
6. 6. Association studies of up to 1.2 million individuals yield new insights into the genetic etiology of tobacco and alcohol use; Liu M, Jiang Y, Wedow R, Li Y, Brazel DM, Chen F, Datta G, Davila-Velderrain J, McGuire D, Tian C, Zhan X; Nature Genetics, Feb 2019
7. 7. Proper conditional analysis in the presence of missing data: Application to large scale meta-analysis of tobacco use phenotypes; Jiang Y, Chen S, McGuire D, Chen F, Liu M, Iacono WG, Hewitt JK, Krauter K, Laakso M, Li KW; PLoS genetics. 2018 Jul 17;14(7):e1007452.
8. 8. Evolution of cell cycle control during metazoa emergence: insights from phylogeny analysis of CDK and Cyclin proteins; Cao L*, Chen F*, Yang X, Xu W, Xie J, Yu L. (Co-first author); Mol Biol Evol 2014 Dec.
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