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同济大学副教授；上海市肺科医院兼聘研究员；硕士和博士生导师；国家科技部评审专家；国家自然科学基金评审专家；上海市科委评审专家；上海市科学技术奖励评审专家；中国免疫学会会员；中国细胞生物学会会员；中国科学院上海生命科学研究院副研究员，上海交通大学医学院副研究员。
Associate Professor, TongjiUniversity; National Natural Science Foundation of China Review Expert;Shanghai Science and Technology Commission Evaluation Expert; Shanghai Scienceand Technology Award Review Expert; Member of the Chinese Society ofImmunology; Member of the Chinese Society of Cell Biology; Associate Professorof Shanghai Institutes for Biological Sciences of Chinese Academy of Sciences(SIBS, CAS), Associate Professor of Shanghai Jiaotong University School ofMedicine.
研究方向：免疫与代谢调控
研究免疫与代谢相互作用的调控网络及分子机制；在细胞水平，探究细胞内代谢通路对免疫细胞活化及功能的影响和分子机制；聚焦代谢分子调控免疫细胞的功能影响疾病的发生和发展。
Immunity and metabolic regulation：
Focuson the regulatory network andmolecular mechanism of immune and metabolic interaction; To explore theinfluence and molecular mechanism of intracellular metabolic pathways on immunecell activation and function at the cell level; Focus on the function ofmetabolic molecules to regulate immune cells to influence the occurrence and development of diseases.
课题组长期致力于免疫代谢调控领域研究，在此过程中聚焦代谢产物通过调控免疫细胞的功能进而改变疾病的发生发展进程，最终发现有效药物靶点；已经在该领域奠定了扎实的理论和实践基础，并取得一系列原创成果，如发现结核菌利用代谢物调控宿主适应性免疫来进行免疫逃避的新机制等，在领域内产生了重要国际影响。研究工作共发表第一作者(含共同)和通讯作者(含共同)论文17篇。包括国际微生物学和免疫学领域重要SCI杂志《Nature Microbiology》（2025）、《NatureMicrobiology》（2024）、《Journal of Immunology》、《Frontiers in immunology》、 《Immunology and cellbiology》和《Scientific Reports》等。研究期间主持多项课题基金，包括国家自然科学基金重大项目、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年项目和上海市卫计委研究基金面上项目等。
主持科研项目：
国家自然科学基金重大项目（2024.1-2028.12）, 子课题负责人 , 175万
国家自然科学基金面上项目 （2016.1-2019.12）,项目负责人, 71.4万
国家自然科学基金青年项目 （2009.1-2011.12）,项目负责人, 20万
上海市卫健委临床研究专项 （2021.1-2023.12;2016.1-2018.12）, 项目负责人,15万
同济大学国家级重大科技成果培育项目（2021.1-2021.12），项目负责人，10万
同济大学自主原创基础研究项目（2024.4-2026.3），项目负责人，12万
上海交通大学医学院附属瑞金医院研究基金（2018.2-2021.2），项目负责人，50万
中国博士后科学基金一等资助（2008.9-2010.2），项目负责人，5万
代表性论文：
1. Hongyu Cheng#; Shenzhi Li#; Hongjie Liu#; Meiyi Yan#; JingxiangWang#; Jingping Huang; Shanshan Liu; Yifan Yang; XinyuCao; Pengfei Cui; Yuanna Cheng; ZhonghuaLiu; Jie Wang; Xiaochen Huang; Lin Wang; Lianhua Qin; Ruijuan Zheng; Carl GFeng; Qiang Zou; Yicheng Sun*; Zhe Ji*; Hua Yang*; Baoxue Ge*; （2025）. Mycobacterium tuberculosis-derivedlinoleic acid increases regulatory T cell function to promote bacterialsurvival within macrophages, Nature Microbiology. doi:10.1038/s41564-025-02140-2
2. Hongyu Cheng#, Zhe Ji#,Yang Wang, Shenzhi Li, Tianqi Tang, Fei Wang, Cheng Peng, Xiangyang Wu, YuannaCheng, Zhonghua Liu, Mingtong Ma, Jie Wang, Xiaochen Huang, Lin Wang, LianhuaQin, Haipeng Liu, Jianxia Chen, Ruijuan Zheng, Carl G. Feng, Xia Cai, Di Qu,Lilin Ye*, Hua Yang* and Baoxue Ge* (2024). Mycobacteriumtuberculosis produces D-serine under hypoxia to limit CD8+ T cell-dependentimmunity in mice. Nature Microbiology, 9(7):1856-1872. Doi: 10.1038/s41564-024-01701-1 (Highlighted by Nature Immunology)
3. Ji, Z. *, Zhou,C., Niu, H., Wang, J., Shen, L. * (2020). Flow Cytometric Analysis ofLymphocyte Infiltration in Central Nervous System during ExperimentalAutoimmune Encephalomyelitis. J. Vis. Exp. 165, e61050:1-10 doi:10.3791/61050.
4. ZheJi#*, Shuai Wu#,Yaru Xu, Jingjing Qi, Xiaohui Su, Lei Shen* (2019). Obesitypromotes EAE through IL-6 and MCP-1-mediated T cells infiltration. Front. Immunol. 10:1881. doi:10.3389/fimmu.2019.01881.
5. Z. Ji, Z.Q. Fan, Y. Zhang, R.H.Yu, H.H. Yang, C.H. Zhou, J. Luo, Z.J. Ke (2014). Thiamine Deficiency PromotesT Cell Infiltration in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis: theInvolvement of CCL2. Journal of Immunology, 193:2157-2167.
6. Z. Ji, Z.J. Ke, J.G. Geng. (2012).SAP Suppresses the Development of Experimental Autoimmune Encephalomyelitis inC57BL6 Mice. Immunology and cell biology, 90(4): 388-395. (Highlighted byA-IMBN and NPG Nature Asia-Pacific)
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