1.  国家自然科学基金基础科学中心，T2488301，2025/01-2030/12，骨干

2.  国家重点研发计划, 2023YFA1800400, 2023-12 -2028-11,  骨干

3.  国家杰出青年科学基金，22225702，2023/01-2027/12，主持

4.  上海市优秀学术带头人计划，22XD1420900， 2022/06-2025/05，主持

5.  国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目，82111540276, 2022-2023，主持

6.  国家自然科学基金重大研究计划集成项目，92153302，2022-2024，骨干

7.  国家自然科学基金面上项目，32071432，2021-2024，主持

8.  中国科学院战略性先导科技专项，XDA12050406，2019-2020，子课题负责人

9.  上海市科委“科技创新行动计划”，19JC1416300，2019-2022，主持

10.  国家自然科学基金面上项目，81872888，2019-2022，主持

11.  国家自然科学基金创新研究群体项目，81821005，2019-2024，骨干

12.  国家自然科学基金重大研究计划重点支持项目，91753203，2018-2021，骨干

13.  国家自然科学基金面上项目，31670066，2017-2020，主持

14.  国家重点研发计划“精准医学研究”专项，2017YFC0906600，2017-2019，骨干

15.  卢嘉锡国际团队项目，2018-2020，课题骨干

16.  中科院科研装备研制项目，YZ201647，2017-2018，课题负责人

17.  中国科学院战略性先导科技专项，XDA12020314， 2016-2017，子课题负责人

18.  上海市科委国际合作项目，15410723100，2015-2018,项目负责人

19.  国家973重点基础研究发展计划，2014CBA02004，2014-2018，课题负责人

20.  国家自然科学基金面上项目，31370814，2014-2017，主持

21.  科技部重大新药创制科技重大专项，2014ZX09507-002，2014-2016，骨干

22.  重大新药创制科技重大专项，2012ZX09301-001-007，2012-2015，骨干

代表性论文

* 通讯作者，#第一作者：

1.     Baijun Dong, Jun-Yu Xu, Yuqi Huang, Jiacheng Guo, Qun Dong, Yanqing Wang, Ni Li, Qiuli Liu, Mingya Zhang, Linhui Zhai, Jing Li*, Wei Xue*, Tan M*, Jun Qin*. Integrative proteogenomic profiling of high-risk prostate cancer samples from Chinese patients indicates metabolic vulnerabilities and diagnostic biomarkers. Nat Cancer 2024, 5:1427-1447

2.     Lu Y, Xu J, Li Y, Wang R, Dai C, Zhang B, Zhang X, Xu L, Tao Y, Han M, Guo R,Wu Q, Wu L*, Meng Z*, Tan M*, Li J*.  DRAK2 suppresses autophagy by phosphorylating ULK1 at Ser56 to diminish pancreatic β cell function upon overnutrition. Sci Transl Med. 2024,16:eade8647

3.     Hu H, Hu W, Guo AD, Zhai L, Ma S, Nie HJ, Zhou BS, Liu T, Jia X, Liu X, Yao X, Tan M*, Chen X*. Spatiotemporal and direct capturing global substrates of lysine-modifying enzymes in living cells. Nat Commun. 2024, 15:1465.

4.     3. Guo A, Yan K, Hu, H, Zhai L, Hu T, Su,H, Chi Y, Zha,J, Xu Y, Zhao,Y Lu X, Xu Y, Zhang J, Tan M*, Chen X*. Spatiotemporal and global profiling of DNA-protein interactions enables discovery of low-affinity transcription factors. Nat Chem. 2023, 15:803-814

5.     Jiang L, Liu S, Jia X, Gong Q, Wen X, Lu W, Yang J, Wu X, Wang X, Suo Y, Li Y, Uesugi M, Qu ZB, Tan M*, Lu X*, Zhou L*. ABPP-CoDEL: Activity-Based Proteome Profiling-Guided Discovery of Tyrosine-Targeting Covalent Inhibitors from DNA- Encoded Libraries. J Am Chem Soc. 2023,145, 46, 25283–25292

6.     Zhou Q, Hao B, Cao X, Gao L, Yu Z, Zhao Y, Zhu M, Zhong G, Chi F, Dai X, Mao J, Zhu Y, Rong P, Chen L, Bai X, Ye C, Chen S, Liang T, Li L, Feng XH*, Tan M*, Zhao B*.  Energy sensor AMPK gamma regulates translation via phosphatase PPP6C independent of AMPK alpha. Mol Cell.  2022, 82:4700-4711

7.     Liu P#, Cong X#, Liao S#, Jia X#, Wang X, Dai W, Zhai L, Zhao L, Ji J, Ni D, Liu Z, Chen Y, Pan L, Liu W, Zhang J, Huang M, Liu B*, Tan M*. Global identification of phospho-dependent SCF substrates reveals a FBXO22 phosphodegron and an ERK-FBXO22-BAG3 axis in tumorigenesis. Cell Death Differ. 2022, 29(1):1-13.

8.     Liu Z, Liu Y, Qian L, Jiang S, Gai X, Ye S, Chen Y, Wang X, Zhai L, Xu J, Pu C, Li J, He F, Huang M*, and Tan M*. A proteomic and phosphoproteomic landscape of KRAS mutant cancers identifies combination therapies. Mol Cell. 2021, 81: 4076-4090

9.     Li Y, Xu J, Lu Y, Bian H, Yang L, Wu H, Zhang X, Zhang B, Xiong M, Chang Y, Tang J, Yang F, Zhao L, Li J, Gao X, Xia M*, Tan M*, Li J*. DRAK2 aggravates nonalcoholic fatty liver disease progression through SRSF6-associated RNA alternative splicing. Cell Metab. 2021 33: 2004–2020.

10.  Xu J, Zhang C, Wang X, Zhai L, Ma Y, Mao Y, Qian K, Sun C, Liu Z, Jiang S, Wang M, Feng L, Zhao L, Liu P, Wang B, Zhao X, Xie H, Yang X, Zhao L, Chang Y, Jia J, Wang X, Zhang Y, Wang Y, Yang Y, Wu Z, Yang L, Liu B, Zhao T, Ren S, Sun A, Zhao Y, Ying W, Wang F, Wang G, Zhang Y, Cheng S, Qin J, Qian X, Wang Y*, Li J*, He F*, Xiao T*, Tan M*. Integrative proteomic characterization of human lung adenocarcinoma. Cell 2020, 182: 245-261

11.  Huang X, Yan J, Zhang M, Wang Y, Chen Y, Fu X, Wei R, Zheng XL, Liu Z, Zhang X, Yang H, Hao B, Shen YY, Su Y, Cong X, Huang M, Tan M*, Ding J*, Geng M*. Targeting Epigenetic Crosstalk as a Therapeutic Strategy for EZH2-Aberrant Solid Tumors. Cell 2018，175:186-199.

12.  Liu B, Jiang S, Li M, Xiong X, Zhu M, Li D, Zhao L, Qian L, Zhai L, Li J, Lu H, Sun S, Lin J, Lu Y *, Li X*, Tan M*. Proteome-wide analysis of USP14 substrates revealed its role in hepatosteatosis. Nat Commun. 2018, 9: 4770

13.  Tan, M.#, Peng, C.#, Anderson, K.A.#, Chhoy, P., Xie, Z., Dai, L., Park, J.S., Chen, Y., Huang, H., Zhang, Y., Ro, J., Wagner, G.R., Green, M.F., Madsen, A.S., Schmiesing, J., Peterson, B.S., Xu, G., Ilkayeva, O.R., Muehlbauer, M.J., Braulke, T., Mühlhausen, C., Backos, D.S., Olsen, C.A., McGuire, P.J., Pletcher, S.D., Lombard, D.B., Hirschey, M.D.*, Zhao, Y*. Lysine Glutarylation Is a Protein Post-Translational Modification Regulated by SIRT5. Cell Metab. 2014,19: 605-617

14.  Tan M.#, Luo H.#, Lee S.#, Jin F., Yang J.S., Montellier E., Buchou T., Cheng Z., Rousseaux S., Rajagopal N., Lu Z., Ye Z., Zhu Q., Wysocka J., Ye Y., Khochbin S., Ren B., Zhao Y*. Identification of 67 histone marks and histone lysine crotonylation as a new type of histone modification. Cell 2011, 146, 1016-1028

15.  Zhang, Z.#, Tan, M.#, Xie, Z., Dai, L., Chen, Y., Zhao, Y.*. Identification of lysine succinylation as a new post-translational modification. Nat Chem Biol. 2011, 7, 58-63

2024年，上海药学科技奖一等奖

2023年，教育部高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)自然科学奖一等奖（2022）

2022年，国家杰出青年科学基金

2022年，第十七届中国青年科技奖

2022年，第十一届上海青年科技英才（基础研究类）

2022年，上海市优秀学术/技术带头人

2020年，中国科学院上海分院第七届杰出青年科技创新人才 

2020年，药明康德生命化学研究奖 

2019年，国家特支计划科技创新领军人才

2019年，中源协和生命医学创新突破奖 

2018年，科技部中青年科技创新领军人才 

2013年，第八届中国人类蛋白组学大会优秀青年学者奖