主持纵向课题：

1. 深化教育领域“放管服”改革研究（上海市教委委托项目，2023）

2. 高校教师学术生涯特征和科研长周期评价研究（上海市教委委托项目，2022）

3. 上海市学校体育政策跟踪分析与评估（上海市学校体育科研项目，2020）

4. 人工智能时代教育科技发展对教育治理的挑战与应对机制研究（上海市政府决策咨询课题，2019，省部级）

5. 上海市教育综改跟踪评价研究（上海高校智库内涵建设计划项目，2019）

6. 高校法人治理结构研究（教育部委托课题，2018，省部级）

7. 高等教育综合改革与高校“双一流”建设的整体推进机制研究（上海市教委委托课题，2018）

8. 校园运动队俱乐部模式研究（上海市学校体育科研项目，2017）

9. 进一步扩大和落实高校办学自主权的路径与策略研究（上海市教委委托课题，2017）

10. 省级教育行政奖励与教育行政处罚的合法性研究（上海市教育法学人才培养计划，2017）

11. 教育行政审批改革与事中事后监督机制研究（上海市教育法学人才培养计划，2016）

12. 省级教育行政部门权力清单（上海市教育法学人才培养计划，2016）

13. 教育治理转型过程中的中国高校法人治理结构研究（教育部人文社科项目，2014，省部级）

主持横向课题：

1. 若干政府决策咨询项目
2. 若干企业研发方向、人才评估咨询项目
3. 若干高校规划、改革和评估咨询项目

1. Zhang, D.; Ding, W.;Wang, Y.; Liu, S. Exploring the Role of International Research  Collaboration in Building China’s World-Class Universities. Sustainability 2022, 14, 3487.
   
2. 张端鸿,陈孙延.疫情防控期间高校在线教育的“组织密码”：一项双案例研究[J].北京教育(高教),2022(12):24-30.
3. 张端鸿,丁文佳.高校五年规划与重点建设的互动关系研究[J].科教发展评论,2022(00):19-26.
   
4. 张端鸿,陈孙延,蔡三发.治理转型:高校发展战略规划制定的范式演进——以A大学“十四五”规划为例[J].复旦教育论坛,2021,19(04):30-36.
   
5. 张端鸿,王倩.院校研究“中国化”之困：条块关系对高校决策系统的影响[J].化工高等教育,2021,38(02):2-9+56.
   
6. 张端鸿,黄雨晴,李兰.高校研究生课题组的组织系统研究——以A大学a课题组为例[J].学位与研究生教育,2021(03):67-72.
   
7. 张端鸿,王倩,蔡三发.学术委员会在高校内部治理中为什么会被边缘化——以A大学为例[J].江苏高教,2020(10):29-36.
   
8. 张端鸿,樊诗慧.我国高校长聘教师制度改革的探索性研究——基于A大学的个案研究[J].高校教育管理,2020,14(04):42-51+86.
   
9. 张端鸿,王晨.中国高校长聘教师制度的战略选择与制度风险[J].高等教育研究,2020,41(07):36-43.
   
10. 张端鸿,陈庆.省级行政区域高等教育政策创新扩散的动力机制研究——以“双一流”政策为例[J].教育发展研究,2019,39(07):53-59.
    
11. 张端鸿.深化改革是高校“双一流”建设的不竭动力[J].教育发展研究,2019,39(01):3.
    
12. 张端鸿,陈庆,邢睿.以公约精神与评价体系完善推动导师和研究生关系建设[J].思想理论教育,2018(09):97-101.
    
13. 张端鸿.院校研究人员职业生涯发展的困境与突破[J].高等工程教育研究,2017(02):131-133.
    
14. 张端鸿,刘波,卞月妍.院校数据仓库架构与建设的过程研究[J].高校教育管理,2017,11(02):26-33.
    

15. 张端鸿.“双一流”:新时期我国院校重点建设政策的延续与调适[J].教育发展研究,2016,36(23):67-72.

16. 张端鸿,蔡三发.循证决策在高校学科规划中的应用——以A大学新一轮学科建设方案决策为例[J].复旦教育论坛,2014,12(04):21-28.

17. 张端鸿.大学治理结构的经济学分析[J].复旦教育论坛,2013,11(06):23-28.