目前在研课题：

[1]     2022年主持院内课题《耳部针灸加速克罗恩病术后康复的临床研究》，2022.06.30-2024.06.30，编号：05.12.22016。

[2]     2023年主持院内横向课题《炎症性肠病吻合口宽度对肠道炎症控制的研究》，2023.01.01-2025.12.31，编号：05.06.22.016。

[3]     2023年主持院内横向课题《经肠梗阻导管灌注益生菌促进克罗恩病缓解的研究》，2023.01.01-2025.12.31，编号：05.06.22.017。

[4]     2025年主持国家自然科学基金面上项目《PDE3B调控CXCR6+ Th17细胞分化参与克罗恩病肠道纤维化发生的机制研究》，2025.01.01-2028.12.31，编号：82470555。

[1]     2008年主持上海市卫生局青年基金课题：大肠癌免疫调节与抑制性T细胞作用机理研究，编号：2008Y090。

[2]     2012年主持国家自然科学基金面上项目：小檗碱通过鸦片类δ受体调控结肠动力和镇痛抗抑郁的研究，编号：81170345。

[3]     2012年作为负责人获国家自然基金国际优秀青年项目资助：Novel synthetic opioids as potential therapeutics for the treatment of gastrointestinal disorders and inflammatory conditions，编号：81250110087。

[4]     2012年、2015年分别主持科技部中国-波兰科技合作项目：研究中国和波兰传统草药提取物的药物活性和作用机理-探索研究抑制胃肠道炎症和疼痛的新型治疗药物（编号35-25）、基础性和早期临床研究小檗碱潜在治疗炎性肠病和肠易激综合征的作用（编号36-25）。

[5]     2019年主持市局级课题《上海市疾病预防控制中心肿瘤防治项目》，2019.01.01-2021.12.31，编号：03.99.17.001。

[6]     2020年主持国家自然科学基金重大项目子项目《O-GlcNAc修饰YAP介导PAICS转录本的m6A甲基化促进肝母细胞瘤增值及检验标志物开发研究》，2020.01.01-2024.12.31，编号：81930066。

[7]     2020年主持完成国自然院内培育项目：褪黑素通过第三类代谢型谷氨酰胺受体治疗腹泻型肠易激综合征的机制研究，2019.01.01-2020.12.31，编号：04.03.18.037。

[8]     2020年主持完成院内临床研究计划：腹腔镜辅助下经自然腔道直肠肿瘤切除术（NOSES）的临床应用，编号：DS04.99.17017。

[9]     2022年主持院内课题《耳部针灸加速克罗恩病术后康复的临床研究》，2022.06.30-2024.06.30，编号：05.12.22016。

[10]  2023年主持院内横向课题《炎症性肠病吻合口宽度对肠道炎症控制的研究》，2023.01.01-2025.12.31，编号：05.06.22.016。

[11]  2023年主持院内横向课题《经肠梗阻导管灌注益生菌促进克罗恩病缓解的研究》，2023.01.01-2025.12.31，编号：05.06.22.017。

[12]  2025年主持国家自然科学基金面上项目《PDE3B调控CXCR6+ Th17细胞分化参与克罗恩病肠道纤维化发生的机制研究》，2025.01.01-2028.12.31，编号：82470555。

近5年发表SCI论文（第一/通讯作者）：

[1]     Wang FT, Wu TQ, Lin Y, Jiao YR, Li JY, Ruan Y, Yin L, Chen CQ. The role of the CXCR6/CXCL16 axis in the pathogenesis of fibrotic disease. Int Immunopharmacol. 2024;132:112015. 

[2]     Wang FT, Lin Y, Yuan XQ, Gao RY, Wu XC, Xu WW, Wu TQ, Xia K, Jiao YR, Yin L, Chen CQ. Predicting short-term major postoperative complications in intestinal resection for Crohn's disease: A machine learning-based study. World J Gastrointest Surg. 2024;16(3):717-730. 

[3]     Wang FT, Gao RY, Wu TQ, Chen CQ. Management of duodenal foreign bodies using the novel combined laparoscopic and endoscopic approaches in two unique cases. Asian J Surg. 2024;47(5):2302-2303. 

[4]     Xia K, Gao R, Li L, Wu X, Wu T, Ruan Y, Yin L, Chen C. Transformation of colitis and colorectal cancer: a tale of gut microbiota. Crit Rev Microbiol. 2023:1-10. 

[5]     Wu T, Wan J, Qu X, Xia K, Wang F, Zhang Z, Yang M, Wu X, Gao R, Yuan X, Fang L, Chen C, Yin L. Nodal promotes colorectal cancer survival and metastasis through regulating SCD1-mediated ferroptosis resistance. Cell Death Dis. 2023;14(3):229. 

[6]     Xia K, Gao RY, Wu XC, Yin L, Chen CQ. Timing of individualized surgical intervention in Crohn's disease. World J Gastrointest Surg. 2022;14(12):1320-1328.

[7]     Wan J, Wu T, Wang K, Xia K, Yin L, Chen C. Polydopamine-modified decellularized intestinal scaffolds loaded with adipose-derived stem cells promote intestinal regeneration. J Mater Chem B. 2022;11(1):154-168. 

[8]     Wan J, Wu T, Liu Y, Yang M, Fichna J, Guo Y, Yin L, Chen C. Mast Cells Tryptase Promotes Intestinal Fibrosis in Natural Decellularized Intestinal Scaffolds. Tissue Eng Regen Med. 2022;19(4):717-726. 

[9]     Wu T, Wan J, Xia K, Yang M, Feng L, Yin L, Chen C. Case Report: Next-Generation Sequencing-Based Detection in A Patient with Three Synchronous Primary Tumors. Front Oncol. 2022;12:910264.

[10]  Xia K, Gao R, Wu X, Ruan Y, Wan J, Wu T, Wang F, Lin Y, Yin L, Chen C. Crohn's Disease Complicated by Rare Types of Intestinal Obstruction: Two Case Reports. Front Med (Lausanne). 2022;9:895202. 

[11]  Xia K, Gao R, Wu X, Sun J, Wan J, Wu T, Fichna J, Yin L, Chen C. Characterization of Specific Signatures of the Oral Cavity, Sputum, and Ileum Microbiota in Patients With Crohn's Disease. Front Cell Infect Microbiol. 2022;12:864944.

[12]  Gao R, Xia K, Wu M, Zhong H, Sun J, Zhu Y, Huang L, Wu X, Yin L, Yang R, Chen C, Qin H. Alterations of Gut Mycobiota Profiles in Adenoma and Colorectal Cancer. Front Cell Infect Microbiol. 2022;12:839435.

[13]  Wan J, Yuan XQ, Wu TQ, Yang MQ, Wu XC, Gao RY, Yin L, Chen CQ. Laparoscopic vs open surgery in ileostomy reversal in Crohn's disease: A retrospective study. World J Gastrointest Surg. 2021;13(11):1414-1422. 

[14]  Wan J, Liu C, Yuan XQ, Yang MQ, Wu XC, Gao RY, Yin L, Chen CQ. Laparoscopy for Crohn's disease: A comprehensive exploration of minimally invasive surgical techniques. World J Gastrointest Surg. 2021;13(10):1190-1201.

[15]  Wan J, Zhang ZC, Yang MQ, Sun XM, Yin L, Chen CQ. Minimally invasive surgery for glycogen storage disease combined with inflammatory bowel disease: A case report. World J Clin Cases. 2021;9(17):4342-4347.

[16]  Liu B, Yang MQ, Yu TY, Yin YY, Liu Y, Wang XD, He ZG, Yin L, Chen CQ, Li JY. Mast Cell Tryptase Promotes Inflammatory Bowel Disease-Induced Intestinal Fibrosis. Inflamm Bowel Dis. 2021;27(2):242-255.

[17]  Yuan X, Chen H, Chen C, Yang M, Li Q, Gao R, Wu X, Xu W, Sun J, Yin L. Minimally invasive treatment of mid-low rectovaginal fistula: a transanal endoscopic surgery study. Surg Endosc. 2020;34(9):3971-3977.

[18]  Chen C, Li M, Liu X, Fan J, Zhang H, Lin S, Yin L, Fichna J, Li Y. Traditional Chinese Medicine Da-Cheng-Qi-Tang Ameliorates Impaired Gastrointestinal Motility and Intestinal Inflammatory Response in a Mouse Model of Postoperative Ileus. Evid Based Complement Alternat Med. 2020;2020:9074069.