1. 大脑中的内源性干细胞在形成神经血管单元中的作用和机制研究，国家自然科学基金重点项目，项目负责人。

2. 免疫因子调控神经干细胞的命运决定及在神经损伤修复中的作用，国家自然科学基金面上项目，项目负责人。

3. 多因子干预下内源性神经干细胞动员对创伤性脑损伤修复的作用和机制研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人。

4. 内源性干细胞对缺血性脑卒中损伤修复的作用和机制研究，上海市教育委员会科研创新计划重大项目，项目负责人。

1. 大脑中的内源性干细胞在形成神经血管单元中的作用和机制研究，国家自然科学基金重点项目，项目负责人。

2. 免疫因子调控神经干细胞的命运决定及在神经损伤修复中的作用，国家自然科学基金面上项目，项目负责人。

3. 多因子干预下内源性神经干细胞动员对创伤性脑损伤修复的作用和机制研究，国家自然科学基金面上项目，项目负责人。

4. 内源性干细胞对缺血性脑卒中损伤修复的作用和机制研究，上海市教育委员会科研创新计划重大项目，项目负责人。

一、科研获奖：

1. 脊髓损伤分子病理与修复机制，上海市自然科学奖，一等奖，2022年度，排名第2.

2. 脊柱脊髓损伤早期控制与全程康复关键技术的建立及应用，中国康复医学会科学技术奖，一等奖，2021年度，排名第2。

3. 脊柱脊髓损伤早期控制与全程康复关键技术的建立及应用，上海康复医学科技奖，一等奖，2021年度，排名第2。

4. 脊柱脊髓损伤修复重建技术与康复策略的建立及应用，华夏医学科技奖，一等奖，2019年度，排名第2。

5. 神经干细胞命运决定的分子机制研究，江西省自然科学奖，一等奖，2018年度，排名第2。

6. 脊柱脊髓损伤再生修复与功能重建研究的临床推广应用，成果推广奖，2018年度，排名第3。

二、部分研究论文

1. Luo Y, Coskun V, Liang A, Yu J,Cheng L, Ge W, Shi Z, Zhang K, Li C, Cui Y, Lin H, Luo D, Wang J, Lin C, Dai Z,Zhu H, Zhang J, Liu J, Liu H, deVellis J, Horvath S, Sun YE*, Li S*.Single-cell transcriptome analyses reveal signals to activate dormant neuralstem cells. Cell. 2015, 161(5):1175-1186. doi: 10.1016/j.cell.2015.04.001.

2. Liu C, Xu S, Liu Q, Chai H, LuoY*, Li S*. Identification of immune cells infiltrating in hippocampus and keygenes associated with Alzheimer's disease. BMC Med Genomics. 2023, 16(1):53. doi:10.1186/s12920-023-01458-2.

3. Zhang X, Xu S, Hu Y, Liu Q, LiuC, Chai H, Luo Y, Jin L*, Li S*. Irisin exhibits neuroprotection by preventingmitochondrial damage in Parkinson's disease. NPJ Parkinsons Dis. 2023, 9(1):13.doi: 10.1038/s41531-023-00453-9.

4. Tong W, Zhang K, Yao H, Li L,Hu Y, Zhang J, Song Y, Guan Q, Li S*, Sun YE*, Jin L*. TranscriptionalProfiling Reveals Brain Region-Specific Gene Networks Regulated in Exercise ina Mouse Model of Parkinson's Disease. Front Aging Neurosci. 2022, 14:891644.doi: 10.3389/fnagi.2022.891644.

5. Li C, Shen H, Liu M, Li S*, LuoY*. Natural antisense RNA Foxk1-AS promotesmyogenic differentiation byinhibiting Foxk1 activity. Cell Commun Signal. 2022, 20(1):77. doi:10.1186/s12964-022-00896-2.

6. Wang Y, Li C, Gong X, Chen X,Liu C, Zhang H, Li S*, Luo Y*. Single-Cell Transcriptomics Reveals SplicingFeatures of Adult Neural Stem Cells in the Subventricular Zone. Front Cell DevBiol. 2022, 10:822934. doi:10.3389/fcell.2022.822934.

7. Liu C, Zhang X, Chai H, Xu S,Liu Q, Luo Y*, Li S*. Identification of Immune Cells and Key Genes associatedwith Alzheimer's Disease. Int J Med Sci. 2022, 19(1):112-125. doi:10.7150/ijms.66422.

8. Xu S, Zhang X, Liu C, Liu Q,Chai H, Luo Y, Li S*. Role of Mitochondria in Neurodegenerative Diseases: Froman Epigenetic Perspective. Front Cell Dev Biol. 2021, 9:688789. doi:10.3389/fcell.2021.688789.

9. Gong X, Cheng J, Zhang K, WangY, Li S*, Luo Y*. Transcriptome sequencing reveals Gastrodia elata Blume couldincrease the cell viability of eNPCs under hypoxic condition by improving DNAdamage repair ability. J Ethnopharmacol. 2022, 282:114646. doi:10.1016/j.jep.2021.114646.

10. Zhang X, Shao Z, Xu S, Liu Q,Liu C, Luo Y, Jin L*, Li S*. Immune Profiling of Parkinson's Disease RevealedIts Association With a Subset of Infiltrating Cells and Signature Genes. Front Aging Neurosci. 2021, 13:605970. doi: 10.3389/fnagi.2021.605970.

11. Zhang X, Feng S, Fan Y, Luo Y,Jin L*, Li S*. Identifying a Comprehensive ceRNA Network to Reveal NovelTargets for the Pathogenesis of Parkinson's Disease. Front Neurol. 2020 Aug4;11:810. doi: 10.3389/fneur.2020.00810.

12. Zhang X, Fan Y, Luo Y, Jin L*,Li S*. Lipid Metabolism is the common pathologic mechanism between Type 2Diabetes Mellitus and Parkinson's disease. Int J Med Sci. 2020, 17(12):1723-1732.doi: 10.7150/ijms.46456.

13. Wang Y, Guo B, Xiao Z, Lin H,Zhang X, Song Y, Li Y, Gao X, Yu J, Shao Z, LiX, Luo Y*, Li S*. Long noncodingRNA CCDC144NL-AS1 knockdown induces naïve-like state conversion of human pluripotentstem cells. Stem Cell Res Ther. 2019, 10(1):220. doi:10.1186/s13287-019-1323-9.

14. Song Y, Chen D, Zhang X, Luo Y*,Li S*. Integrating genetic mutations and expression profiles for survivalprediction of lung adenocarcinoma. Thorac Cancer. 2019, 10(5):1220-1228. doi:10.1111/1759-7714.13072.

15. Wang H, Zhang K, Liu Y, Fu Y,Gao S, Gong P, Wang H, Zhou Z, Zeng M, Wu Z, Sun Y, Chen T, Li S*, Liu L*.Telomere heterogeneity linked to metabolism and pluripotency state revealed bysimultaneous analysis of telomere length and RNA- seq in the same humanembryonic stem cell. BMC Biol. 2017, 15(1):114. doi: 10.1186/s12915-017-0453-8.

16. Chen Y, Yu J, Niu Y, Qin D, LiuH, Li G, Hu Y, Wang J, Lu Y, Kang Y, Jiang Y, Wu K, Li S, Wei J, He J, Wang J,Liu X, Luo Y, Si C, Bai R, Zhang K, Liu J, Huang S, Chen Z, Wang S, Chen X, BaoX, Zhang Q, Li F, Geng R, Liang A, Shen D, Jiang T, Hu X, Ma Y, Ji W*, Sun YE*.Modeling Rett Syndrome Using TALEN-Edited MECP2 Mutant Cynomolgus Monkeys.Cell. 2017, 169(5): 945-955

17. Shao Z, Wang H, Zhou X, Guo B,Gao X, Xiao Z, Liu M, Sha J, Jiang C, Luo Y, Liu Z*, Li S*. Spontaneousgeneration of a novel foetal human retinal pigment epithelium (RPE) cell lineavailable for investigation on phagocytosis and morphogenesis. Cell Prolif.2017, 50(6):e12386. doi: 10.1111/cpr.12386.

18. Gong X, Wang Y, Zeng J, Li S*,Luo Y*. Computational identification and experimental validation of microRNAsbinding to the fragile X syndrome gene Fmr1. Neurochem Res. 2015, 40(1):109-17.doi: 10.1007/s11064-014-1471-3.

19. Zhang K, Huang K, Luo Y*, Li S*.Identification and functional analysis of long non-coding RNAs in mousecleavage stage embryonic development based on single cell transcriptome data.BMC Genomics. 2014, 15(1):845. doi: 10.1186/1471-2164-15-845.

20. Liu H, Chen Y, Niu Y, Zhang K,Kang Y, Ge W, Liu X, Zhao E, Wang C, Lin S, Jing B, Si C, Lin Q, Chen X, Lin H,Pu X, Wang Y, Qin B, Wang F, Wang H, Si W, Zhou J, Tan T, Li T, Ji S, Xue Z,Luo Y, Cheng L, Zhou Q, Li S*, Sun YE*, Ji W*. TALEN-mediated gene mutagenesisin rhesus and cynomolgus monkeys. Cell Stem Cell. 2014, 14(3):323-328. doi:10.1016/j.stem.2014.01.018