上海市肺科医院结核科是国内最早结核病防治和研究机构，为中华医学会结核病学分会和中国防痨协会的发源地，中国医疗保健国际交流促进会结核病防治分会和上海市医学会结核病学专科分会创建单位，《中国防痨杂志》主编与《中华结核和呼吸杂志》副总编单位。医院结核科获得了：上海市感染性疾病（结核病）临床医学研究中心、上海市重点专科、上海市“重中之重”临床重点学科等重大项目，先后承担国家十一五、十二五、十三五重大科技专项、国家重点基础研究发展计划等重大项目，具备全国范围内结核病临床、预防和基础研究长期紧密的合作基础。

    目前结核科临床科室是全国结核病患者诊治体量最多的结核专科之一，作为上海市耐多药专家组组长单位，以诊治疑难、危重和耐多药结核病为特色，指导全市耐多药肺结核鉴别诊断及治疗工作。在肺部疑难杂症鉴别诊治、支气管介入治疗、非结核分枝杆菌肺病、耐药肺结核和肺外结核的诊治均居国内领先水平。连续6年在中国医院科技影响力排行榜名列结核病专科排名国内第二。

    依托本单位组建的上海市结核病(肺)重点实验室，是国内最早成立的专门从事结核病基础和应用研究的省级重点实验室，拥有教育部“长江学者”特聘教授领衔，青年千人、国自然优青等为骨干的实力雄厚的研究团队。实验室具备进行分枝杆菌细菌学、细胞生物学、生物化学和分子生物学实验操作的基本仪器和条件，重点开展了结核病基础和临床转化研究。在Nature、Nature Microbiology、Nature Communications、Cellular & Molecular Immunology和Journal of Immunology等重要期刊发表系列研究论文。

1. 国家自然科学基金   CYP2E1、SOD2基因多态性与抗结核药物所致肝损伤易感性的相关性及其机制研究

2.上海市自然科学基金  TRAF4催化GroES泛素化修饰促进结核分枝杆菌感染巨噬细胞异体自噬的机制研究  

3.上海市“科技创新行动计划”医学创新研究专项项目  基于肺组织MHC II呈递抗原肽芯片诊断脓肿分枝杆菌肺病的临床应用评价

4.上海市科委西医引导项目  新型淋巴细胞转化试验鉴定抗结核药物所致超敏反应及其机制研究

5. 上海市浦江人才计划  TNXRD1和SLCO1B1基因与抗结核药物所致肝损伤易感性机制和细胞分子模型的建立

6.上海市公共卫生体系建设三年行动计划-“优秀学科带头人”计划  结核肉芽肿免疫图谱分析及药物治疗预后免疫标志物的研究

7.上海市感染性疾病（结核病）临床医学研究中心（19MC1910800）

1. 国家自然科学基金   CYP2E1、SOD2基因多态性与抗结核药物所致肝损伤易感性的相关性及其机制研究

2.上海市自然科学基金  TRAF4催化GroES泛素化修饰促进结核分枝杆菌感染巨噬细胞异体自噬的机制研究  

3.上海市“科技创新行动计划”医学创新研究专项项目  基于肺组织MHC II呈递抗原肽芯片诊断脓肿分枝杆菌肺病的临床应用评价

4.上海市科委西医引导项目  新型淋巴细胞转化试验鉴定抗结核药物所致超敏反应及其机制研究

5. 上海市浦江人才计划  TNXRD1和SLCO1B1基因与抗结核药物所致肝损伤易感性机制和细胞分子模型的建立

6.上海市公共卫生体系建设三年行动计划-“优秀学科带头人”计划  结核肉芽肿免疫图谱分析及药物治疗预后免疫标志物的研究

7.上海市感染性疾病（结核病）临床医学研究中心（19MC1910800）

1. 采用高通量测序、质谱等新型分子技术快速诊断结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌及其耐药性，提高结核病的病原学检出阳性率10%以上，大大缩短耐药检测性时间（48h内），准确率90-94%，研究成果发表在Infection, Molecular Medicine, Eur J Med Res, microorganisms等杂志；含利奈唑胺方案治疗脓肿分枝杆菌肺病的疗效与安全性（2023，Annals of ClinicalMicrobiology and Antimicrobials）

2. 揭示了巨噬细胞是MTB感染后产生IL-16的主要来源，IL-16可通过抑制吞噬体成熟和抑制Rev-erbα的表达来促进MTB的胞内存活，IL-16在MTB感染过程中的免疫抑制作用并可能成为一个潜在的治疗靶点（2024，Emerg Microbes Infect）

3. 发现抗结核药物所致肝损伤易感基因及其相关机制，鉴定出抗结核药物性肝损伤预后相关的新型生物标志物，研究结果被中华医学会的《抗结核药物所致肝损伤诊断与处理》指南所引用，发表在Pharmacotherapy，Clin Drug Invest，中华结核和呼吸杂志等杂志上；

4. 开发初治敏感肺结核新型短程化疗新方案，治疗疗程较标准方案缩短2个（2023，Emerg Microbes Infect）。

近年发表论文：

1.Effectivenessand safety of regimens containing linezolid for treatment of Mycobacteriumabscessus Pulmonary Disease. Annals of Clinical Microbiology andAntimicrobials. 2023, 22:106.

2.Mycobacteriumtuberculosis hijacks host macrophages-derived interleukin 16 to blockphagolysosome maturation for enhancing intracellular growth. Emerg MicrobesInfect. 2024, 13(1): 2322663.

3.Performance of theMeltPro TB assay as initial test for diagnosis of pulmonary tuberculosis withdrug-resistance detection. Molecular Medicine, 2023;29(1):153.

4. Diagnosticperformance of metagenomic next-generation sequencing in non-tuberculousmycobacterial pulmonary disease when applied to clinical practice. Infection.2023,51:397-405.

5. EBUS-GSwith the GeneXpert MTB/RIF assay for diagnosis of Mycobacterium tuberculosis infectionof isolated pulmonary nodules. Eur J Med Res. 2023, 28: 370.

6. Genetic Polymorphismsin Antioxidant Enzymes Modulate the Susceptibility of IdiosyncraticAntituberculous Drug-Induced Liver Injury and Treatment Outcomes in PatientsWith Tuberculosis. Pharmacotherapy.2020,40(1): 4-16

7. Metabolic Profiles of Clinical Isolates of Drug-Susceptible andMultidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis: A Metabolomics-Based Study.Infection and Drug Resist. 2023, 16: 2667-2680.

8.  Factors Associated with Treatment Outcome inPatients with Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease: A LargePopulation-Based Retrospective Cohort Study in Shanghai. Trop. Med. Infect.Dis. 2022, 7(2): 27.