生命科学与技术学院-张云芳导师介绍
张云芳
教授
硕，博士生导师
女
生命科学与技术学院
生物学
父系获得性遗传,RNA修饰与表观遗传调控
zhangyunfang@tongji.edu.cn
博士招生专业
1
生物学（博士）
2024
2
学术型博士
遗传、发育与疾病
2
生物学（博士）
2024
1
专业学位博士
干细胞与表观遗传
硕士招生专业
1
生物学（博士）
2024
1
学术型硕士
干细胞与表观遗传
2011年毕业于延边大学，获学士学位。2014年毕业于安徽大学（与中科院动物研究所联合培养），获理学硕士学位。2018年毕业于中国科学院大学中国科学院动物研究所，获理学博士学位。期间获国家留学基金委资助在内华达大学里诺医学院Dr. Qi Chen实验室进行联合培养。2018年至2021年作为引进人才就职于中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院从事专职科研工作。2021年11月加入同济大学生命科学与技术学院，受聘同济大学“青年百人计划”A岗教授。
主要从事表观遗传学修饰及父系获得性遗传调控机制研究，发现精子tsRNA及其RNA修饰可作为一类新型表观遗传信息载体介导父系获得性代谢紊乱性状的代际遗传（2016，Science）。进一步阐明了Dnmt2作为关键基因通过调控RNA修饰参与了精子tsRNA介导的获得性遗传（2018，Nature Cell Biology），提出“精子RNA编码指纹”重编程子代健康的概念（2019，Nature Reviews Endocrinology）。此外，还建立了适用于tsRNA等复杂非编码小RNA的建库分析方法-PANDORA-Seq（2021，Nature Cell Biology），在前期发现tsRNA在血清（2014, JMCB）和精子中大量富集的基础上，进一步证明tsRNA在多种组织细胞中广泛富集，并发现tsRNA和rsRNA具有影响胚胎干细胞分化的功能（2021, Nature Cell Biology）。部分研究成果入选2016年“中国科学十大进展”及“中国生命科学领域十大进展”，获2019年“全国妇幼健康科学技术奖自然科学奖一等奖”。作为项目及课题负责人主持国家级科研项目3项，其中包括国家自然科学基金优青项目（2021-2024）、国家自然科学基金面上项目（2020-2024），国家重点研发计划“发育编程及其代谢调节”重点专项课题（2019-2024）。曾获得吴瑞奖、中科院院长特别奖、中国科学院大学BHPB Scholarship、中国科学院优秀博士毕业生、北京市普通高等学校优秀毕业生、入选中国科学院优秀博士学位论文等荣誉和奖励。
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科研项目
1. 主持国家自然科学基金优秀青年基金项目：tsRNA与父系获得性遗传（82022029），在研；
2. 主持国家重点研发计划专项课题：发育与代谢异常获得性性状的临床预警和干预（2019YFA0802604），在研；
3. 主持国家自然科学基金面上项目：Dnmt2 调控精子 tsRNA 介导父代表观遗传印记信息形成的机制研究（81971460），在研；
4. 主持重庆市自然科学基金杰出青年基金项目：精子 tsRNA及其 RNA修饰介导获得性代谢疾病跨代遗传的分子机制研究（cstc2019jcyjjqX0010），已结题；
5. 主持重庆英才·青年拔尖人才项目（CQYC201905038），已结题。
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研究成果
已发表文章：（*共同第一作者；#共同通讯作者）
1.Huanping Guo*, Lin Xia*, Wei Wang*, Wei Xu*, Xipeng Shen, Xiao Wu, Tong He, Xuelin Jiang, Yinying Xu, Pan Zhao, Dongmei Tan, Xi Zhang#, Yunfang Zhang#. Hypoxia induces alterations in tRNA modifications involved in translational control. BMC Biology. (2023) Feb 21;21(1):39.
2.Lin Xia*, Huanping Guo*, Xiao Wu*, Yinying Xu*, Pan Zhao*, Bingbing Yan, Yunjing Zeng, Yundi He, Dan Chen, Robert Peter Gale, Yunfang Zhang #, Xi Zhang#. Human circulating small non-coding RNA signature as a non-invasive biomarker in clinical diagnosis of acute myeloid leukaemia. Theranostics. (2023) Feb 13;13(4):1289-1301.
3.Huanping Guo*, Xipeng Shen*, Hua Hu*, Peng Zhou, Tong He, Lin Xia, Dongmei Tan，Xi Zhang #, and Yunfang Zhang #. Alteration of RNA modification signature in human sperm correlates with sperm motility. Molecular Human Reproduction. (2022) Aug 12; 28(9):gaac031.
4.Tong He*, Huanping Guo*, Lin Xia*, Xipeng Shen, Yun Huang, Xiao Wu, Xuelin Jiang, Yinying Xu, Yi Tan, Yunfang Zhang #, Dongmei Tan #. Alterations of RNA Modification in Mouse Germ Cell-2 Spermatids Under Hypoxic Stress. Frontiers in Molecular Biosciences. (2022) Jun 14; 9:871737.
5.Bin Wang, Lin Xia, Dan Zhu, Hongtao Zeng, Bin Wei, Likui Lu, Weisheng Li, Yajun Shi, Jingliu Liu, Yunfang Zhang# & Mao Sun#. Paternal High-Fat Diet Altered Sperm 5‘tsRNA-Gly-GCC Is Associated with Enhanced Gluconeogenesis in the Offspring. Frontiers in Molecular Biosciences. (2022) Apr 11;9:857875.
6.Junchao Shi*, Yunfang Zhang*, Dongmei Tan*, Xudong Zhang*, Menghong Yan*, Ying Zhang*, Marta Shahbazi, Kirsty Mackinlay, Reuben Franklin, Shichao Liu, Bemhard Kuhle, Emma R, James, Liwen Zhang, Yongcun Qu, Qiwei Zhai, Wenxin Zhao, Linlin Zhao, Changcheng Zhou, Weifeng Gu, Jernej Murn, Jingtao Guo, Douglas T. Carrell, Yingsheng Wang, Xuemei Chen, Bradley R. Cairms, Xianglei Yang, Paul Schimmel, Magdalena Zemicka-Goetz, Sihem Cheloufi#, Ying Zhang#, Tong Zhou#, Qi Chen#. PANDORA-Seq expands the repertoire of regulatory small RNAs by overcoming RNA modifications. Nature Cell Biology (2021) Apr 05; 23(4), 424-436.
7.Tong He*, Huanping Guo*, Xipeng Shen*, Xiao Wu, Lin Xia, Xuelin Jiang, Yinying Xu, Dan Chen, Yunfang Zhang#, Dongmei Tan#, Yi Tan#. Hypoxia-induced alteration of RNA modifications in the mouse testis and sperm. Biology of Reproduction. 2021 Nov 15;105(5):1171-1178.
8.Yunfang Zhang*, Junchao Shi*, Minoo Rassoulzadegan, Francesca Tuorto and Qi Chen#. Sperm RNA code programmes the metabolic health of offspring. Nature Reviews Endocrinology. (2019) Jun 24; (15):489–498.
9.Jun Chao Shi*, Yunfang Zhang*, Tong Zhou#, Qi Chen#. tsRNAs: The Swiss Army Knife for Translational Regulation. Trends in Biochemical Sciences. (2019) Mar;44(3):185-189.
10.Yunfang Zhang*, Xudong Zhang*, Junchao Shi*, Francesca Tuorto*, Xin Li*, Yusheng Liu, Reinhard Liebers, Tong Zhou, Wei Yan, Frank Lyko, Ying Zhang#, Qi Zhou#, Enkui Duan#, Qi Chen#. Dnmt2 mediates intergenerational transmission of paternally acquired metabolic disorders through sperm small non-coding RNAs. Nature Cell Biology. (2018) April 24(20),535-540.
-Highlighted in Nature Reviews Endocrinology;
11.Yunfang Zhang*, Junchao Shi, Qi Chen#. tsRNAs: new players in mammalian retrotransposon control. Cell Research. (2017) Nov;27(11):1307-1308.
12.Qi Chen*, Menghong Yan*, Zhonghong Cao*, Xin Li*, Yunfang Zhang*, Junchao Shi*, Gui-hai Feng, Hongying Peng, Xudong Zhang, Ying Zhang, Jingjing Qian, Enkui Duan#, Qiwei Zhai# and Qi Zhou#. Sperm tsRNAs contribute to intergenerational inheritance of an acquired metabolic disorder. Science. (2016) Jan 22;351(6271):397-400.
-News story by Science
-Highlighted in Nat Rev Genet, Cell Metab, Cell Res, FASEB J, Bio Reprod, and Science Bulletin.
13.Junchao Shi*, Yunfang Zhang* and Qi Chen#. Molecular carriers of acquired inheritance: absence of evidence is not evidence of absence. Environmental Epigenetic. (2016) 2 (2): dvw014;
14.Yunfang Zhang*, Ying Zhang*, Junchao Shi*, He Zhang, Zhonghong Cao, Xuan Gao, Wanhua Ren, Yunna Ning, Lina Ning, Yujing Cao, Yongchang Chen, Weizhi Ji, Zi-jiang Chen#, Qi Chen#, and Enkui Duan#. Identification and characterization of an ancient class of small RNAs enriched in serum associating with active infection. Journal of Molecular Cell Biology. (2014) 6:172-174.
-Cover Story -Editor’s Recommendation
15.张云芳; 张莹; 陈琦#; 段恩奎#; 精子RNA 及RNA 修饰在获得性遗传中的研究进展。《生命科学》 (2018), 30(11): 1202-1209.
16.杨程*；夏琳*；赫童；苟阳；唐永杰；彭贤贵；张曦#；张云芳#。表观遗传学修饰在血液肿瘤中的研究进展。《生物化学与生物物理进展》.(2020) 年第 05 期。
17.作为副主编撰写了《医话血液》科普书籍，重庆大学出版社，2020年10月1日。
18.Xiaohua Lei#*; Yujing Cao*; Baohua Ma*; Yunfang Zhang; Lina Ning; Jingjing Qian; Liwen Zhang; Yongcun Qu; Tao Zhang; Dehong Li; Qi Chen; Junchao Shi; Xudong Zhang; Chiyuan Ma; Ying Zhang#; Enkui Duan#; Development of mouse preimplantation embryos in space. National Science Reviews. 2020, nsr(nwaa062)
19.Jingjing Qian; Yunfang Zhang; Yongcun Qu; Liwen Zhang; Junchao Shi; Xudong Zhang; Shichao Liu; Kim BH; Hwang SJ; Tong Zhou; Qi Chen; Ward SM; Enkui Duan#; Ying Zhang#; Caffeine consumption during early pregnancy impairs oviductal embryo transport, embryonic development and uterine receptivity in mice. Biology of Reproduction, (2018), 99(6): 1266-1275.
20.Lina Ning*, Xiaohua Lei*, Yujing Cao, Yunfang Zhang, Zhonghong Cao, Qi Chen, Enkui Duan#. Effect of Short-Term Hypergravity Treatment on Mouse 2-Cell Embryo Development. Microgravity Sci. Technol. (2015) 27:465–471;
21.He Zhang*, Ying Zhang*, Huashan Zhao, Yunfang Zhang, Qi Chen, Hongying Peng, Li Lei Jingqiao Qiao, Junchao Shi, Zhonghong Cao, Enkui Duan#, Yaping Jin#. Hormonal regulation of ovarian bursa fluid in mice and involvement of aquaporins. PLOS ONE. (2013) May 22;8(5):e63823.
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学校介绍
同济大学是国家教育部直属重点大学，也是首批被批准成立研究生院、并被列为国家“ 211 工程”和“面向 21 世纪教育振兴行动计划”(985 工程)与上海市重点建设的高水平研究型大学之一。同济大学创建于 1907 年，现已成为拥有理、工、医、文、法、经(济)、管(理)、哲、教(育)9 大门类的研究型、综合性、多功能的现代大学。
同济大学现设有各类专业学院 22 个，还建有继续教育学院、 职业技术教育学院等，设有经中德政府批准合作培养硕士研究生的中德学院、中德工程学院，与法国巴黎高科大学集团合作举办的中法工程和管理学院等。目前学校共有 81 个本科专业、 140 个硕士点、 7 个硕士专业学位授权点、博士授权点 58 个、 13 个博士后流动站，学校拥有国家级重点学校 10 个。各类学生 5 万多人，教学科研人员 4200 多人，其中有中科院院士 6 人、工程院院士 7 人，具有各类高级职称者 1900 多人，拥有长江学者特聘教授岗位 22 个。作为国家重要的科研中心之一，学校设有国家、省部级重点实验室和工程研究中心等国家科研基地 16 个。学校还设有附属医院和 2 所附属学校。
近年来同济大学正在探索并逐步形成有自己特色的现代教育思想和办学理念。以本科教育为立校之本，以研究生教育为强校之路。确立“知识、能力、人格”三位一体的全面素质教育和复合型人才培养模式。坚持“人才培养、科学研究、社会服务、国际交往”四大办学功能协调发展，努力强化服务社会的功能，实现大学功能中心化。以国家科技发展战略和地区经济重点需求为指针，促进传统学科高新化、新兴学科强势化、学科交叉集约化。与产业链紧密结合，形成优势学科和相对弱势学科互融共进的学科链和学科群，构建综合性大学的学科体系，其中桥梁工程、海洋地质、城市规划、结构工程、道路交通、车辆工程、环境工程等学科在全国居领先地位。在为国家经济建设和社会发展做贡献的过程中，争取更多的“单项冠军”，提升学校的学术地位和社会声誉。学校正努力建设文理交融、医工结合、科技教育与人文教育协调发展的综合性、研究型、国际知名高水平大学。
同济大学已建成的校园占地面积 3700 多亩，分五个校区，四平路校区位于上海市四平路，沪西校区位于上海市真南路，沪北校区位于上海市共和新路，沪东校区位于上海市武东路。正在建设中的嘉定校区位于安亭上海国际汽车城内。
同济大学研究生院简介
同济大学一贯重视研究生教育，早在 20 世纪 50 年代初即在部分专业招收培养研究生。 1978 年学校恢复招收硕士研究生， 1981 年起招收博士研究生，同年被国务院学位委员会批准为首批有权授予博士、硕士学位的单位。 1986 年经国务院批准试办研究生院， 1996 年经评估正式成立研究生院，成为我国培养高层次专门人才的重要基地之一。同济大学现有一级学科博士学位授权点 12 个，二级学科博士学位授权点 68 个(含自主设置 10 个二级学科博士点)，硕士学位授权点 147 个(含自主设置 7 个二级学科硕士点)，分属哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学等 9 个学科门类。其中土木工程、建筑学、交通运输工程、海洋科学、环境科学与工程、力学、材料科学与工程等学科处在全国优势和领先地位，机电、管理、理学等学科近年有了长足进展。我校还设有 13 个博士后科研流动站。近些年来，为了适应我国经济建设和社会发展的需要，学校还十分注重培养不同类型、多个层次、多种规格的高层次专门人才。学校既设科学学位，又设工商管理、行政管理、建筑学、临床医学、工程硕士(含 21 个工程领域)、口腔医学等多种专业学位；既培养学术型、研究型研究生，又培养应用型、复合型专业学位研究生；既有在校全日制攻读学位模式，又有在职人员攻读专业硕士学位或以同等学力申请硕士学位、中职教师在职攻读硕士学位、高校教师在职攻读硕士学位模式。此外，还面向社会举办多种专业研究生课程进修班等，充分发挥了我校学科优势和特色，由此形成了多渠道、多规格、多层次的办学模式，取得了良好的社会效益。
同济大学研究生院是校长领导下具有相对独立职能的研究生教学和行政管理机构，下设招生办公室、管理处、培养处、学位办公室、学科建设办公室和行政办公室。同时，学校党委还专门设立了研究生工作部。学校设有校学位评定委员会，各学院有学位评定分委员会，并设立了各学科、专业委员会，配有学位管理工作秘书、教务员、班主任、研究生教学秘书等教辅人员。研究生院曾多次被评为全国和上海市学位与研究生教育管理工作先进集体。
二十多年来，同济大学始终把全面提高培养质量作为研究生教育改革的指导思想，在严格质量管理方面采取了一系列切实有效的措施，取得了较好效果。在连续多年全国百篇优秀博士学位论文评选中，有 7 篇入选。同济大学为国家培养了一大批高素质的高级专门人才，至今已授予博士学位 1311 人，硕士学位近 9504 人，其中有相当一部分已成为我国社会主义现代化建设的重要骨干力量。至 2004 年 9 月，在校博士、硕士研究生约达 11000 多人，专业学位硕士生约 2700 人。根据本校研究生教育发展规划， 2006 年计划招收博士生、硕士生(含专业学位研究生)超过 4000 名。同济大学正在为我国经济建设和社会发展输送高层次人才做出更大的贡献。
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同济大学硕士研究生学费及奖助政策
收费和奖励
1) 按照国务院常务会议精神，从 2014 年秋季学期起，向所有纳入国家招生计划的新入学研究生收取学费。其中：工程管理硕士(125600)、MBA[微博](125100)、MPA(125200)、法律硕士(非法学)(035101)、软件工程领域工程硕士(085212)、金融硕士(025100)、会计硕士(125300)、翻译硕士(055101、055109)、护理硕士(105400)、教育硕士(045100)、汉语国际教育硕士(045300)、人文学院(210)的艺术硕士(135108)专业学位研究生的学费标准另行公布，其它硕士研究生学费不超过 8000 元/学年。
2) 对非定向就业学术型研究生和非定向就业专业学位硕士研究生，同济大学有完善的奖励体系(工程管理硕士(125600)、MBA(125100)、MPA(125200)、法律硕士(非法学)(035101)、软件工程硕士(085212)、金融硕士(025100)、会计硕士(125300)、翻译硕士(055101、055109)、护理硕士(105400)、教育硕士(045100)、汉语国际教育硕士(045300)、人文学院(210)的艺术硕士(135108)的奖励由培养单位另行制订)。对亍纳入奖励体系的非定向就业学术型硕士生和非定向就业专业学位硕士生在入学时全部都可以获得 8000 元/学年的全额学业奖学金，该奖学金用以抵充学费。对纳入奖励体系的硕士研究生还可获得不少亍 600 元/月的励学金，每年发放10 个月。另外，纳入奖励体系的非定向就业研究生都可以申请励教和励管的岗位，获得额外的资励。所有非定向就业硕士研究生在学期间纳入上海市城镇居民基本医疗保险，可申请办理国家励学贷款，可参加有关专项奖学金评定。
3)工商管理硕士在职班、金融硕士在职班、公共管理硕士、工程管理硕士、会计硕士、护理硕士、教育硕士、汉语国际教育硕士、人文学院的艺术硕士采取在职学习方式，考生录取后，人事关系不人事档案不转入学校，在读期间不参加上海市大学生医疗保障，学校不安排住宿，毕业时不纳入就业计划。
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