生命科学与技术学院-刘晓雨导师介绍
刘晓雨
教授
硕，博士生导师
女
生命科学与技术学院
生物学
,生物学
干细胞与表观遗传,单细胞测序,体细胞重编程
liuxiaoyu@tongji.edu.cn
博士招生专业
1
生物学（博士）
2023
1
学术型博士
生物信息学
2
生物学
2023
1
学术型博士
干细胞与表观遗传
招生信息
1
生物学
2023
1
学术型硕士
干细胞与表观遗传
刘晓雨博士，长聘教授，博导，第六批国家高层次人才特殊支持计划青年拔尖人才计划获得者，获多项科技部、基金委及上海市项目支持。主要研究方向为哺乳动物胚胎发育过程中的表观遗传调控机制。表观遗传修饰的重塑在全能性的建立过程中发挥重要作用，但具体调控机制尚不清楚。近年来，课题组通过对小鼠和人早期胚胎发育过程中表观遗传修饰重编程机制的研究，1）建立了植入前胚胎发育多种核心组蛋白修饰的图谱，鉴定了多个表观调控因子并初步解析了其作用机制，揭示了早期胚胎逆转座子沉默的表观调控机制；2）解析了核移植胚胎的组蛋白修饰和染色质高级结构重编程机制，并通过改变表观修饰显著提高核移植胚胎发育率。相关成果发表在Nature、Cell Stem Cell、Nature Cell Biology、Cell Research等国际著名学术期刊上，这些研究拓展了对哺乳动物早期表观修饰重编程过程的认识，一篇论文入选ESI高被引论文，一项成果入选2016年“中国生命科学领域十大进展”。未来的研究中，课题组将继续围绕全能性重建这一核心问题，深入探究转录调控因子协同表观修饰发挥作用的分子机制，为表观修饰调控胚胎发育机制的研究提供新的理论基础。
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科研项目
1，细胞谱系分化的分子机制与类胚胎构建，主持，500万元 ，2022 年12月至2027 年11 月，科技部国家重点研发计划青年科学家项目（国家级）2022YFA1106000 ，在研；
2，国家高层次人才支持计划青年拔尖人才，主持， 180万元 ，2022年1月至2024年12月，中组部青年拔尖人才（国家级），在研；
3，细胞全能性获得的表观调控机制及基于干细胞的类胚胎构建，骨干，500万元，2021年12月至 2026年6月， 国家重点研发计划青年科学家项目（国家级）2021YFA1102900 ，在研；
4，组蛋白H3.3变体在小鼠早期胚胎组蛋白修饰遗传与重编程中的作用与机制研究，主持，58万，2021年1月至2024年12月，国自然面上（国家级）32070802 ，结题；
5，胚胎基因组激活过程中关键转录因子的筛选及其机制研究，主持，40万，2020年6月至2023年5月，上海市科委启明星计划（省部级），20QA1409700 ，结题；
6，植入前胚胎发育的调控网络研究，骨干，2732万元，2018年12月至2021年12月， 国家重点研发计划（国家级）2018YFC1004000，结题；
7，小鼠早期胚胎发育过程中组蛋白H3K4me3修饰长度变化的调控机制及其作用，主持，25万元，2018.01-2020.12，国自然青年项目（国家级）31701262，结题。
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研究成果
1, Ruimin Xu1, Qianshu Zhu 1, Yuyan Zhao, Mo Chen, Lingyue Yang, Shijun Shen, Guang Yang, Zhifei Shi, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Hong Wang, Cizhong Jiang*, Chong Li*, Sharong Gao*, Xiaoyu Liu*. (2023). Unreprogrammed H3K9me3 prevents minor zygotic genome activation and lineage commitment in SCNT embryos. Nature communications, 14(1), 4807
2，Xiaolei Zhang1, Ruimin Xu1, Yuyan Zhao, Yijia Yang, Qi Shi, Hong Wang, Xiaoyu Liu*, Shaorong Gao*, Chong Li*, Setd2 overexpression rescues bivalent gene expression during SCNT-mediated ZGA, Protein & Cell, 2025;, pwaf010
3，Ruimin Xu1, Sen Li1, Qiu Wu1, Chong Li1, Manxi Jiang1, Lei Guo, Mo Chen, Lingyue Yang, Xin Dong, Hong Wang, Chenfei Wang*, Xiaoyu Liu*, Xianghong Ou*, Shaorong Gao*. Stage-specific H3K9me3 allocations ensure retrotransposon silencing in human preimplantation embryos. Cell Stem Cell, 2022.
4, Chenfei Wang1, Chuan Chen1, Xiaoyu Liu1, Chong Li1, Qiu Wu, Xiaolan Chen, Lingyue Yang, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Hong Wang, Yawei Gao*, Yong Zhang*, Shaorong Gao*.Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation. Cell Research, 2022
5, Lingyue Yang1, Xiaocui Xu1, Ruimin Xu, Chuan Chen, Xiaolei Zhang, Mo Chen, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Hong Wang, Xiaoyu Liu*, Shaorong Gao*, Chong Li*.Aberrant nucleosome organization in mouse SCNT embryos revealed by ULI-MNase-seq. Stem Cell Reports, 2022
6, Xu Rumin1, Li Chong1, Liu Xiaoyu*, Gao Shaorong*. Insights into epigenetic patterns in mammalian early embryos. Protein & Cell. 2021
7, Xiaolei Zhang, Shaorong Gao*, Xiaoyu Liu*, "Advance in the Role of Epigenetic Reprogramming in Somatic Cell Nuclear Transfer-Mediated Embryonic Development", Stem Cells International, vol. 2021,
8，Chen, Mo1; Zhu, Qianshu1; Li, Chong1; Kou, Xiaochen; Zhao, Yanhong; Li, Yanhe; Xu, Ruimin; Yang, Lei; Yang, Lingyue; Gu, Liang; Wang, Hong; Liu, Xiaoyu*; Jiang, Cizhong*; Gao, Shaorong*; Chromatin architecture reorganization in murine somatic cell nuclear transfer embryos, Nature Communications，2020.
9, Tiegang Meng1, Qian Zhou1, Xueshan Ma1, Xiaoyu Liu1, Qingren Meng, Xianju Huang, Honglin Liu, Wenlong Lei , Zhenghui Zhao, Yingchun Ouyang, Yi Hou, Heide Schatten, Xianghong Ou*, Zhenbo Wang *, Shaorong Gao* & Qingyuan Sun *.PRC2 and EHMT1 regulate H3K27me2 and H3K27me3 establishment across the zygote genome. Nature Communications, 2020
10，Chenfei Wang1, Xiaoyu Liu1, Yawei Gao*1, Lei Yang1, Chong Li, Wenqiang Liu, Chuan Chen, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Jiayu Chen, Yixuan Wang, Rongrong Le, Hong Wang, Tao Duan, Yong Zhang*, Shaorong Gao*. Reprogramming of H3K9me3-dependent heterochromatin during mammalian embryo development. Nature Cell Biology，2018,20(5):620-631 (co-first author)
11， Yawei Gao1, Xiaoyu Liu1, Bin Tang1, Chong Li1, Zhaohui Kou, Lin Li, Wenqiang Liu, You Wu, Xiaochen Kou, Jingyi Li, Yanhong Zhao, Jiqing Yin, Hong Wang, She Chen, Lujian Liao*, Shaorong Gao*. Protein expression landscape of mouse embryos during pre-implantation development. Cell Reports, 2017, 21(13):3957-3969 (co-first author)
12，Xiaoyu Liu1, Chenfei Wang1, Wenqiang Liu1, Jingyi Li1, Chong Li, Xiaochen Kou, Jiayu Chen, Yanhong Zhao, Haibo Gao, Hong Wang, Yong Zhang*, Yawei Gao*, Shaorong Gao*. Distinct features of H3K4me3 and H3K27me3 chromatin domains in pre-implantation embryos. Nature, 2016. 537: p.558-562.
13，Wenqiang Liu1, Xiaoyu Liu1, Chenfei Wang1, Yawei Gao1*, Rui Gao, Xiaochen Kou, Yanhong Zhao, Jingyi Li, You Wu, Wenchao Xiu, Su Wang, Jiqing Yin, Wei Liu, Tao Cai, Hong Wang, Yong Zhang*, Shaorong Gao*. Identification of key factors releasing cloned embryo arrests by combining embyo biopsy and single-cell sequencing. Cell Discovery, (2016) 2, 16010; doi:10.1038/celldisc.2016.10. (co-first author)
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学校介绍
同济大学是国家教育部直属重点大学，也是首批被批准成立研究生院、并被列为国家“ 211 工程”和“面向 21 世纪教育振兴行动计划”(985 工程)与上海市重点建设的高水平研究型大学之一。同济大学创建于 1907 年，现已成为拥有理、工、医、文、法、经(济)、管(理)、哲、教(育)9 大门类的研究型、综合性、多功能的现代大学。
同济大学现设有各类专业学院 22 个，还建有继续教育学院、 职业技术教育学院等，设有经中德政府批准合作培养硕士研究生的中德学院、中德工程学院，与法国巴黎高科大学集团合作举办的中法工程和管理学院等。目前学校共有 81 个本科专业、 140 个硕士点、 7 个硕士专业学位授权点、博士授权点 58 个、 13 个博士后流动站，学校拥有国家级重点学校 10 个。各类学生 5 万多人，教学科研人员 4200 多人，其中有中科院院士 6 人、工程院院士 7 人，具有各类高级职称者 1900 多人，拥有长江学者特聘教授岗位 22 个。作为国家重要的科研中心之一，学校设有国家、省部级重点实验室和工程研究中心等国家科研基地 16 个。学校还设有附属医院和 2 所附属学校。
近年来同济大学正在探索并逐步形成有自己特色的现代教育思想和办学理念。以本科教育为立校之本，以研究生教育为强校之路。确立“知识、能力、人格”三位一体的全面素质教育和复合型人才培养模式。坚持“人才培养、科学研究、社会服务、国际交往”四大办学功能协调发展，努力强化服务社会的功能，实现大学功能中心化。以国家科技发展战略和地区经济重点需求为指针，促进传统学科高新化、新兴学科强势化、学科交叉集约化。与产业链紧密结合，形成优势学科和相对弱势学科互融共进的学科链和学科群，构建综合性大学的学科体系，其中桥梁工程、海洋地质、城市规划、结构工程、道路交通、车辆工程、环境工程等学科在全国居领先地位。在为国家经济建设和社会发展做贡献的过程中，争取更多的“单项冠军”，提升学校的学术地位和社会声誉。学校正努力建设文理交融、医工结合、科技教育与人文教育协调发展的综合性、研究型、国际知名高水平大学。
同济大学已建成的校园占地面积 3700 多亩，分五个校区，四平路校区位于上海市四平路，沪西校区位于上海市真南路，沪北校区位于上海市共和新路，沪东校区位于上海市武东路。正在建设中的嘉定校区位于安亭上海国际汽车城内。
同济大学研究生院简介
同济大学一贯重视研究生教育，早在 20 世纪 50 年代初即在部分专业招收培养研究生。 1978 年学校恢复招收硕士研究生， 1981 年起招收博士研究生，同年被国务院学位委员会批准为首批有权授予博士、硕士学位的单位。 1986 年经国务院批准试办研究生院， 1996 年经评估正式成立研究生院，成为我国培养高层次专门人才的重要基地之一。同济大学现有一级学科博士学位授权点 12 个，二级学科博士学位授权点 68 个(含自主设置 10 个二级学科博士点)，硕士学位授权点 147 个(含自主设置 7 个二级学科硕士点)，分属哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学等 9 个学科门类。其中土木工程、建筑学、交通运输工程、海洋科学、环境科学与工程、力学、材料科学与工程等学科处在全国优势和领先地位，机电、管理、理学等学科近年有了长足进展。我校还设有 13 个博士后科研流动站。近些年来，为了适应我国经济建设和社会发展的需要，学校还十分注重培养不同类型、多个层次、多种规格的高层次专门人才。学校既设科学学位，又设工商管理、行政管理、建筑学、临床医学、工程硕士(含 21 个工程领域)、口腔医学等多种专业学位；既培养学术型、研究型研究生，又培养应用型、复合型专业学位研究生；既有在校全日制攻读学位模式，又有在职人员攻读专业硕士学位或以同等学力申请硕士学位、中职教师在职攻读硕士学位、高校教师在职攻读硕士学位模式。此外，还面向社会举办多种专业研究生课程进修班等，充分发挥了我校学科优势和特色，由此形成了多渠道、多规格、多层次的办学模式，取得了良好的社会效益。
同济大学研究生院是校长领导下具有相对独立职能的研究生教学和行政管理机构，下设招生办公室、管理处、培养处、学位办公室、学科建设办公室和行政办公室。同时，学校党委还专门设立了研究生工作部。学校设有校学位评定委员会，各学院有学位评定分委员会，并设立了各学科、专业委员会，配有学位管理工作秘书、教务员、班主任、研究生教学秘书等教辅人员。研究生院曾多次被评为全国和上海市学位与研究生教育管理工作先进集体。
二十多年来，同济大学始终把全面提高培养质量作为研究生教育改革的指导思想，在严格质量管理方面采取了一系列切实有效的措施，取得了较好效果。在连续多年全国百篇优秀博士学位论文评选中，有 7 篇入选。同济大学为国家培养了一大批高素质的高级专门人才，至今已授予博士学位 1311 人，硕士学位近 9504 人，其中有相当一部分已成为我国社会主义现代化建设的重要骨干力量。至 2004 年 9 月，在校博士、硕士研究生约达 11000 多人，专业学位硕士生约 2700 人。根据本校研究生教育发展规划， 2006 年计划招收博士生、硕士生(含专业学位研究生)超过 4000 名。同济大学正在为我国经济建设和社会发展输送高层次人才做出更大的贡献。
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同济大学硕士研究生学费及奖助政策
收费和奖励
1) 按照国务院常务会议精神，从 2014 年秋季学期起，向所有纳入国家招生计划的新入学研究生收取学费。其中：工程管理硕士(125600)、MBA[微博](125100)、MPA(125200)、法律硕士(非法学)(035101)、软件工程领域工程硕士(085212)、金融硕士(025100)、会计硕士(125300)、翻译硕士(055101、055109)、护理硕士(105400)、教育硕士(045100)、汉语国际教育硕士(045300)、人文学院(210)的艺术硕士(135108)专业学位研究生的学费标准另行公布，其它硕士研究生学费不超过 8000 元/学年。
2) 对非定向就业学术型研究生和非定向就业专业学位硕士研究生，同济大学有完善的奖励体系(工程管理硕士(125600)、MBA(125100)、MPA(125200)、法律硕士(非法学)(035101)、软件工程硕士(085212)、金融硕士(025100)、会计硕士(125300)、翻译硕士(055101、055109)、护理硕士(105400)、教育硕士(045100)、汉语国际教育硕士(045300)、人文学院(210)的艺术硕士(135108)的奖励由培养单位另行制订)。对亍纳入奖励体系的非定向就业学术型硕士生和非定向就业专业学位硕士生在入学时全部都可以获得 8000 元/学年的全额学业奖学金，该奖学金用以抵充学费。对纳入奖励体系的硕士研究生还可获得不少亍 600 元/月的励学金，每年发放10 个月。另外，纳入奖励体系的非定向就业研究生都可以申请励教和励管的岗位，获得额外的资励。所有非定向就业硕士研究生在学期间纳入上海市城镇居民基本医疗保险，可申请办理国家励学贷款，可参加有关专项奖学金评定。
3)工商管理硕士在职班、金融硕士在职班、公共管理硕士、工程管理硕士、会计硕士、护理硕士、教育硕士、汉语国际教育硕士、人文学院的艺术硕士采取在职学习方式，考生录取后，人事关系不人事档案不转入学校，在读期间不参加上海市大学生医疗保障，学校不安排住宿，毕业时不纳入就业计划。
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